一天毛利小五郎收到一张请帖，里面是谜样男子的委托，需要前往横滨的一个游乐场。小五郎和柯南一行人快乐地到达欢乐的游乐场，还带上了可以出入无阻代表VIP的手表，不料正中那名神秘男子的圈套。所有带上手表的人不得离开游乐场，否则便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点，柯南和小五郎如果不能解开谜题，兰和少年侦探团也会随着游乐园粉身碎骨。然而更意想不到的是，那名男子居然直接称呼柯南为工藤新一。
故事开始于一座孤岛之上，在这里，居住着一群动物们，其中，十分勇敢对于新鲜事物有着无尽好奇心的鹦鹉麦克（大卫·霍华德·桑顿 David Howard Thornton 配音）对小岛外面的世界十分的向往，可是其他的动物们却并不这么想，小岛是他们的安乐窝，小岛以外对于他们来说就是致命的危险地带。 一天，一艘遇难的商船冲向了小岛，为小岛带来了他们唯一的一位人类客人鲁滨逊（马提亚斯·施维赫夫 Matthias Schweigh?fer 配音），鹦鹉最先跟鲁滨逊成为了朋友。起初，鲁滨逊因为和其他动物们无法沟通导致了双方产生了小小的误会，但很快，他们之间就产生了真挚的友谊。
又是一年圣诞节到来，邦妮在摆放着圣诞树的房间里和伙伴们玩耍，玩具们乐得和小主人玩耍，但是三角龙崔茜（克里斯汀·沙尔 Kristen Schaal 配音）似乎对自己不被当作恐龙看待多有不满。少顷，妈妈喊邦妮一起去梅森家过节，邦妮匆匆将伍迪、巴斯光年、雷克斯、崔茜以及新来的天使Kitty猫塞入包中后出发。到了梅森家，邦妮惊讶地发现这个男孩正沉湎于电子游戏中，稍作迟疑后，她便将书包丢到了梅森的玩具房。伍迪他们爬了出来，发现这里仿佛是失落了已久的玩具世界。未过多久，他们进入了一个全部由恐龙战士组成的王国。以恐龙将军（凯文·麦克基德 Kevin McKidd 配音）为首的战士们脑子里只有战斗和侵略，似乎忘记了作为玩具的使命。
