伊森·亨特（汤姆·克鲁斯饰）和队友们接到了追回三个大杀伤性核武器的任务。眼见任务马上就能完成，但为了挽救其中一位队友卢瑟（文·瑞姆斯饰）的生命，三个核武器被人趁机带走。中情局负责人斯隆女士（安吉拉·贝塞特饰）调来她手下的得意猛将沃克（亨利·卡维尔饰），让他盯着伊森·亨特完成追回核武器的任务。期间，女特工伊尔莎（丽贝卡·弗格森饰）突然出现，伊森·亨特发现，他要面对的并不只是恐怖分子，还有潜藏在政府部门的内鬼。
这看似太平盛世的烟火人间，其实并非只有人类存在。一直以来，世间的小妖小仙都化作人形生活在我们身边，之中有与人为善者，自然也有作恶多端者，而维持这一切秩序和平的人，便是隐匿江湖的秘密组织，雾隐门。 恶妖天邪企图利用太岁铲除雾隐门建造妖国，却不料太岁意外附到了吴因身上。自此，吴因由一名地痞流氓变成了依靠太岁力量施展绝技的高人，但行为举止也常会被太岁左右。与此同时，雾隐门弟子风小小为寻太岁踪迹找到了吴因，试图阻止天邪为祸世间的计划。最终，吴因决定利用自身的力量操控太岁，以阻止天邪的邪恶计划，拯救万千百姓。就在他与风小小联手击败天邪的同时，一个在风小小心中隐藏了多年的秘密，终于浮出水面……
在尼比鲁星球探查期间，企业号舰长柯克（克里斯·派恩Chris Pine 饰）为营救史波克（扎克瑞·昆图 Zachary Quinto 饰）采取了胆大妄为的举动，几乎危及全舰队员的生命，他也为此付出代价。不久，柯克官复原职，而伦敦发生一起死亡超过四十人的恐怖袭击事件。该事件的始作俑者约翰·哈里森（本尼迪克特·康伯巴奇 Benedict Cumberbatch 饰）正来自联盟内部。此后他驾驶飞机袭击了高层会议，柯克最为敬重的派克将军不幸遇难。为了阻止哈里森的外逃阴谋，柯克重新率领企业号启程追击。危机重重的旅途，他和舰员、朋友之间的信任也受到巨大考验。 当他们最终找到哈里森，才终于知晓他的真实身份，以及伦敦袭击事件背后的阴谋和黑幕……
