《小医生》是依据迪特里希·格吕纳麦耶教授（Dietrich Gr?nemeyer）的同名儿童读物改编，讲述了小医生的探险之旅。纳诺姐弟自幼失去父母，是爷爷奶奶带他们长大。爷爷山迪是园艺工人，在斯诺特教授实验室工作。斯诺特教授运用剽窃的缩微技术，可以将机器人缩小到纳米级别，植入人体后可以控制人类大脑。他借为山迪医治腰伤机会，将机器人植入山迪体内。恰好被来找爷爷的纳诺撞见......纳诺的同学莉莉请求纳诺帮忙复习生物课，他们发现爷爷行为怪异......
阳光明媚的一天，东都体育场正进行一场东京Spirit和大阪钢巴的精彩足球比赛，江户川柯南（高山南 配音）、灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士以及少年侦探团的伙伴们齐齐到场呐喊助威。城市的另一边，事务所...
又是一年圣诞节到来，邦妮在摆放着圣诞树的房间里和伙伴们玩耍，玩具们乐得和小主人玩耍，但是三角龙崔茜（克里斯汀·沙尔 Kristen Schaal 配音）似乎对自己不被当作恐龙看待多有不满。少顷，妈妈喊邦妮一起去梅森家过节，邦妮匆匆将伍迪、巴斯光年、雷克斯、崔茜以及新来的天使Kitty猫塞入包中后出发。到了梅森家，邦妮惊讶地发现这个男孩正沉湎于电子游戏中，稍作迟疑后，她便将书包丢到了梅森的玩具房。伍迪他们爬了出来，发现这里仿佛是失落了已久的玩具世界。未过多久，他们进入了一个全部由恐龙战士组成的王国。以恐龙将军（凯文·麦克基德 Kevin McKidd 配音）为首的战士们脑子里只有战斗和侵略，似乎忘记了作为玩具的使命。
