《南京的那个夏天》从老百姓的视角讲述了南京人民对美好生活的执着与热爱。有着十五年安全驾驶记录的普通大巴司机贺南京,因与妻子卫莉婚后长期不孕,面临来自各方面的压力,两人的感情和婚姻遭遇危机。在卫莉离开贺南京的那段日子里,贺南京偶然邂逅单亲男孩童童。在照顾童童并与他一起生活的日子里,贺南京、卫莉相继重新领悟并找回了爱情与生活的真谛。
在农贸市场卖蔬菜的王静华做生意热心诚信,她生活的全部希望都在十五岁的儿子夏小宇身上。夏小宇热爱音乐,和几个同学共同组建了一支少年乐队,这在王静华眼里就是不务正业,母子俩因此产生了矛盾和隔阂,就在此时,一场突如其来的灾难降临到这个家庭。