西元2199年,来自太阳系外的敌人加米拉斯帝国,为了挽救母星的危亡,开始侵略其他星球。地球军在与加米拉斯帝国军的交战中惨败,同时加米拉斯帝国军向地球发射大量含有放射能的游星炸弹。地球的抵抗力量越来越弱。本与加米拉斯为双子星球的伊斯坎达尔星球仗义相助,向地球发送了波动引擎和波动炮的设计图纸,并告知地球军本星球拥有清除放射能的设备“宇宙清洗器D”。在与欧洲、美洲失去联系的情况下,地球防卫军利用伊斯坎达尔星球提供的技术将沉睡于海底的大和号改造为宇宙战舰。大和号全体乘员踏上了取回“宇宙清洗器D”的漫漫征程。
秋津政之助(浪川大辅 配音)容易害羞的懦弱性格让他在生活上吃了不少的苦头,因此而丢失的工作更是不计其数。一日,刚刚被解雇的阿政遇见了一神秘男子。男子自称弥一(樱井孝宏 配音),想雇佣阿政担任个人保镖的职务,无所事事的阿政当即答应。没想到这次偶遇竟将阿政卷入了一宗绑架案件中去,而弥一正是江湖大名鼎鼎的犯罪团伙“五叶”的首领。会有怎样的遭遇等待着无辜的阿政呢? 迫于生计,阿政成为了五叶的一份子。在五叶中,谜一样的弥一,美丽妖艳的阿竹(大浦冬华 配音),刀子嘴豆腐心的梅造(高冢正也 配音),沉默寡言的松吉(内田夕夜 配音),在和他们相处的过程中,阿政发现了这些身份扑朔迷离,个性亦正亦邪的浪人们不为人知的另一面。
在从便利商店回家的路上,突然被异世界召唤的少年菜月昴。在无法依靠任何东西的异世界,无力的少年手唯一的力量……那是“死去然后重新开始”的力量。为了守护最重要的人们,为了取回确实存在着又无可替代的时间,少年抗拒着绝望,勇敢地面对着残酷的命运。(本次新编集版在第一季动画基础上追加新场景,以2话合并成1话的形式制作成单集时长1小时的特别篇)