故事设定在前作时代的300年后，讲述一个代号为幽灵的邪恶女巫，因为祖先被47浪人所杀，决心复仇的她妄图毁灭所有武士，47浪人的后裔会让她如愿以偿吗？
一个神秘的暗杀机构的年轻新手发现自己在执行第一次暗杀任务中开始变得极度危险，她必须追踪一群危险的人贩子。
上古时期，妖神之战虽已过千年，但世间的恶念贪欲仍不断滋生，不仅引致禁锢妖神之力的神器封印逐渐松动，各方势力更为此蠢蠢欲动。 为阻止妖神再度现世，仙界之首、长留掌门白子画邀众仙派联手，对抗七杀叛变，并召回神器再度封印。但此期间，一个叫“花千骨”的凡人女子竟意外闯入仙界。 自幼，花千骨便身陷“天煞孤星”之宿命，受尽人世偏见之苦，为改变命运，她一心拜白子画为师。重重考验之下，花千骨不仅成为白子画的座下弟子，两人更因朝夕相对，互生情愫，不料却被卷入一个巨大的阴谋之中……
1928年7月，国民党第十二军军长孙殿英以军事演习为名，秘密挖掘了清东陵慈禧墓和乾隆墓，盗窃了无数的稀世珍宝，但这些财宝下落不明。据民间传说，孙殿英将部分财宝贿赂给了上司徐源泉，徐源泉便将财宝埋在了自家公馆的地下秘室中。文革期间，有人在武汉新洲徐公馆附近挖出了不少枪支军备，结果有关徐公馆藏有巨宝的说法不胫而走。影片以武汉新洲仓埠古镇徐源泉将军的古宅及密道为依托，首次通过影片的形式向世人公开此历史文化古迹。考古专业毕业生雪莹跟随考古专家古莫教授等人进入徐公馆考古，考古队在古宅的地下秘道内发现一件宝物，宝物在押送途中被匪徒抢走，之后教授等人与男女神偷、国外文物团伙尤大等人激烈争夺，宝物丢失后，匪徒陆续遭受报应，并出现系列离奇死亡事件，一场正义与邪恶的较量由此开始......
冷血杀手专杀嫖客，将受害者的下体割去。负责调查的古Sir毫无头绪，马夫金大班亦追查此事。警署食堂员工亚毛是虔诚教徒，遇上一伴唱女郎，惊为天人，露出可怖身份。
康熙帝（井淼 饰）知道自己离世的日子已经不远，因此决定将皇位传给十四太子（莫少聪 饰）。然而，十四太子却突然遭到神秘蒙面杀手的袭击，幸好得到亲信曾静（徐少强 饰）的救助才幸免于难。 原来，四太子早就对皇位心生妄念，他派人暗杀了自己的胞弟十四太子。然而，四太子的计划失败后，他试图收买曾静，但未成功。于是，他四处寻找有才干的人才，最终找到了文武双全的年羹尧（白彪 饰），并诱使了反清文人吕留良（谷峰 饰）及其侄女吕四娘（刘雪华 饰）等人加入他的阵营。四太子假装承诺如果帮助他登上皇位，就会履行"满汉一家"的协议，以此拉拢年羹尧等人的支持。这场政治博弈中，各方势力争相角逐，暗流涌动。权谋与阴谋交织在一起，每个人都为了自己的利益而不断斗争。
武师陈厚德（元华 饰）远赴美国开设宝芝林，时常召唤国内的徒弟阿杰（李连杰 饰）来美国帮衬，但阿杰担忧在美的居留问题，迟迟未到。陈厚德曾经收下一名美国弟子尊尼（杰瑞?特林伯 饰），尊尼学成后却挑战师傅，意欲扬名立万扩张自己的武馆，陈厚德被尊尼打成重伤，宝芝林也被砸烂，幸好有少女安娜路过，将陈厚德救走。几乎同时，阿杰终于来美探望师傅，岂料一出机场便遭遇各种麻烦，先是莫名其妙收下三名落魄墨西哥少年为弟子，又与查封宝芝林的银行地产部经理阿美（郭锦恩 饰）不吵不相识。阿杰因语言不通，守候宝芝林寻找师傅下落，而尊尼也在四处打探陈厚德的去向，一中一外两名弟子，将为义与利的不同追求狭路相逢……
清朝时，广州一地的反清复明义士积极与台湾郑成功一脉联络，以图驱逐异族。义士段将军与何老师等人为了营救反清同志，先后被广州将军天达镇压，何老师的学生刘裕德（刘家辉 饰）因积极参与反清，举家被天达手下鹰犬唐三要所害，刘裕德孤身逃脱，历尽艰苦抵达少林寺，希望能够习得少林功夫，救助苦难百姓，兼报家仇。其时少林寺设有三十五房，其中三十四房分别锻炼体力或拳脚兵器，法号三德的刘裕德天资过人，历经五年苦学，遍通三十四房，学成之际，刘裕德向方丈提出开设少林第三十六房，旨在接纳俗家弟子，传播少林武学。刘裕德离乡七年后重返广州，收洪熙官、陆阿采等青年为徒，与清廷鹰犬展开了连番激战…… 本片获1978年亚洲影展最佳动作效果奖。
动作指导李森（董玮 饰）本已息影多年，因昔日拍档导演欲完成人生最后一部作品才重出江湖；沉醉电影却苦无机会的动作演员李世龙（刘俊谦 饰），一直在理想与现实边缘苦苦挣扎。两代动作演员偶然相遇，一拍即合，决意凭这部“最后之作”令港产动作片再次发光发热。森更渴望借此重振名声，让婚礼在即的女儿Cherry（蔡思韵 饰）能面上有光，修补疏离的父女关系。然而，重返片场的森却顿觉一切已今非昔比，更与曾结怨的男主角、现已为知名动作巨星的梁志威（伍允龙 饰）狭路相逢。两人对何谓香港动作片精神看法分歧，龙夹在森与威的新仇旧恨间左右为难，拍摄过程中的种种难关与森的一段过往令他逐渐对森及动作片的前路产生怀疑...一件突发事故，更将师徒俩推向失控边缘.……
