作为实现愿望的代价，在无人知晓的情况下不断战斗的魔法少女们。然而，环伊吕波，却忘记了自己的愿望。“成为魔法少女的时候，我是许了什么愿望来着？”日常当中突然出现的空洞。失去了的某件重要之物。连理由都不知道，就这样每天不停地战斗…… 就在此时，魔法少女之间开始流传某个传闻。“若能去神滨的话，魔法少女就能得到拯救”。魔法少女与传闻集中的城市，神滨市。寻求着自己失去的愿望，环伊吕波的故事开始了——
表面上，宫川敦志（置鲇龙太郎 配音）是一个身高一米八的成熟男性，可实际上，他只是一个年仅12岁的少年。由于身高而在女生中间有着意外高的人气的他，却也因此有着不少的烦恼。敦志的姐姐宫川敦美（钉宫理惠 配音）目前在读高中二年级，可有着一米三七超娇小个头的她，常常被误认为是敦志的妹妹。 上天开了小小的玩笑，而这倒置的两人却在困扰和麻烦中努力的生活着。喜欢着敦志的沙夜（平野绫 配音），十分在意敦志的班主任盛山二见（田宫智惠 配音），一直陪伴着敦志的好友小绿（柏山奈奈美 配音）和小纯（东城咲耶子 配音），每一个善良而单纯的人们都在用自己特殊的方式默默的帮助着姐弟两。
