《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
载初元年，神都洛阳。武后大权独揽，称帝在即，她向全天下发布“求才诏”，宣布重开殿试。消息一出，全国能人贤士蜂拥而至，此时洛阳城却冒出来一只肆无忌惮的狐妖，她神出鬼没，专爱偷袭年轻举子。举子接连失踪，坊间谣言漫天，百姓惶惶不安。 精通“圜诡之术”的连山堂后人裴坤也在此时来到洛阳，阴差阳错卷入了一场声势浩大的“捉妖”行动，裴坤凭一己之力击退狐妖，并揪出了潜伏在太平公主身边的春秋道杀手白鹤，高调亮相的裴坤引起洛阳城内多方势力注意。 裴坤一心想要完成师父遗愿查清当年真相，他联手羽林卫和司刑寺，并且武后的情报总管公子楚也向他抛出橄榄枝。原来公子楚早已监测到蛰伏已久的古老组织春秋道即将重现江湖，狐妖只是障眼法……
被撤职的锦衣卫袁小棠与青梅竹马的方雨亭为寻找父亲失踪的线索潜入鬼街、在朋友石尧山等人的帮助下，一路逛鬼街、破机关、遇各路神秘人物……乱斗与阴谋轮番上演，随着旧事的重提，一切谜团都渐渐有了答案。
