在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
特种兵沈辣天生阴阳眼，在云南边境抓捕毒枭任务中，偶入古滇国山洞，遭遇远古祭祀干尸复活，沈辣小分队几乎全军覆没。在这危急时刻，神秘白发男子吴勉将沈辣和缉毒警察孙德胜一并救出。干尸事件后，二人机缘巧合进入“民俗事务调查研究局”，在一次次超自然事件中逐渐成长，揭开另一个世界的面纱。 这是一个无处不在却不为人知的世界 这个世界里，有一个神通广大隐匿在世人视野之外的神秘部门 有一群身怀秘术活得风生水起的凡人 还有那些超脱了轮回却依旧混迹凡尘的传奇 于芸芸众生而言，他们是看不见摸不着却又实实在在的坚强护盾 于邪魔外道而言，他们是令人欲除之而后快的眼中钉肉中刺 而对他们自己而言，他们只是有血有肉的人 有爱有恨，有喜有悲，身在大千世界，心怀大千世界 微不足道，却又重要无比。
