统领十二星座的方氏一族是当今世界上最强大的家族，而本该继承统领之位的狮子座万适存（白澍 饰）却遭到了方太太的陷害，她派出刺客企图除掉万适存，并且大力扶持自己的儿子方天泽（肖战 饰）上位。 一晃眼多年过去，超能星学院迎来了一位转校生程芝儿（王玉雯 饰），哪知道这个可怜的女孩初来乍到就因为得罪了天秤座会长李亚当（彭楚粤 饰）而遭到了同学的排挤，不仅如此，她和方天泽、霍贝贝（徐晓璐 饰）三人亦陷入了复杂的三角关系之中。幸运的是，程芝儿在校园之中遇见了并不知道自己身世的万适存，后者向她伸出援手，甚至为了她而参加了“超能之星”的比赛。在赛场上，万适存和方天泽相遇了，这命运般的邂逅使得历史的车轮再度转动了起来。
不同于长剧和一般的短剧，《乘龙怪婿2》每集为一个独立的故事，无论观众从哪集开始看都不会觉得突兀。每集的名字也极为搞笑，如“超级壮男，想壮就壮，壮得漂亮”、“头文字龟”。
程念一跟随李思泽来到李思泽的故乡阴阳镇做客，两人在阴阳镇遇到鬼神邪说，一桩桩离奇怪谈事件背后实则是难以捉摸的诡谲人心。待真相层层揭开，程念一和李思泽发现笼罩在鬼神谣言邪说之下的阴阳镇隐藏着更大秘密，经过重重阻碍，两人联手抓到凶手，拆除鬼母庙，阴阳镇的生活也因此恢复了安和宁静。
解放战争后期，我军西线围歼战役即将取得胜利。国民党西线部队独立团趁着夜色向西逃去。上级将参与西部战役的某师调往东线，于是该师派出庄连长带领小分队，在当地军分区的配合下，继续追击敌军。这股国民党残部隐匿在黑山寺待命，并且有不少士兵患上传染病。追击部队遵照“尽量保护当地百姓，减少我部伤亡，设法迫降敌军，并给予救治，以后甄别整编”的上级指示展开行动。庄连长得知当地韦医生心向共产党且医术好，前往寻找，不料敌方先行将韦医生骗上山。庄连长等扮作韦医生的助手进入寺院，与韦医生配合一边治疗病人，阻断疫情，以免病情蔓延至当地百姓中，一边了解坑道结构。最终我方控制了疫情，并通过坑道救出了希望脱离国民党的士兵。至此，国民党独立团残部掌控的黑山寺恢复了安定，疫情没有蔓延，特殊的剿匪与解救任务圆满完成。
