解放战争后期,我军西线围歼战役即将取得胜利。国民党西线部队独立团趁着夜色向西逃去。上级将参与西部战役的某师调往东线,于是该师派出庄连长带领小分队,在当地军分区的配合下,继续追击敌军。这股国民党残部隐匿在黑山寺待命,并且有不少士兵患上传染病。追击部队遵照“尽量保护当地百姓,减少我部伤亡,设法迫降敌军,并给予救治,以后甄别整编”的上级指示展开行动。庄连长得知当地韦医生心向共产党且医术好,前往寻找,不料敌方先行将韦医生骗上山。庄连长等扮作韦医生的助手进入寺院,与韦医生配合一边治疗病人,阻断疫情,以免病情蔓延至当地百姓中,一边了解坑道结构。最终我方控制了疫情,并通过坑道救出了希望脱离国民党的士兵。至此,国民党独立团残部掌控的黑山寺恢复了安定,疫情没有蔓延,特殊的剿匪与解救任务圆满完成。
长安首富李义因一场官商纠葛,从摘星台一跃而下,只留下一个孤子李麒形,在叔叔李正的庇护下隐姓埋名。转眼间,李麒形已蛰伏十年,成为了一县长官。连日的大雨,不仅让长安城变得泥泞不堪,也让那座象征着权力与腐败的摘星楼轰然倒塌。殷素素是东安县首富之女,却热衷医术,殷府厨娘被杀,李麒形因此与殷素素结缘,开启了一同断案的旅程。
海洲市公安局长遭遇枪击昏迷不醒,原省公安厅刑侦处处长田丰临危受命,空降海洲任代理局长之职,在副局长胡克艰和刑警队长赵梦楠配合下对冉江案展开全面调查。此时,神秘杀手再次现身医院,试图接近冉江。在调查杀手的过程中,又一位知名企业家遇害,俩家涉黑KTV的领班杜大浩走入警方视线,成为最大嫌疑人。同时,几次大的扫黑行动也因泄密而失败,警局内部潜伏着黑帮卧底,警察也收到来自黑帮的重要线报。一场关于卧底与反卧底的盘查在警局和黑帮内部展开,究竟谁是卧底?黑白之争、正邪之战,又将何去何从?