在《纳米核心》的里世界中，各位主角配角以及龙套们，都要在“纳米学院”中学习生活。大家在这个世界不那么认真地上课、考试、过着奇奇怪怪的校园日常，并不正经地保护着这个世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。
插花婆婆老年丧女，因无法接受现实，受奸人“亦邪”的蛊惑，种下一株能“借尸还魂”的仙草。多年后，仙草长成了一座活着的大山——玲珑山，其方圆数十里内的万物生灵因诅咒发生了变异。小道士小宇外出寻找师傅，途中误入玲珑山，发现了它的秘密，而随着玲珑山的成熟，传说中死去的小女孩也即将复活……
一个偶然拥有“家庭”的杀手，在经历了家庭温暖、感受光明之后，要开始保护世界去赎罪的故事。
