《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事 大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
被称为第一废物的吴燃在一次战斗重伤中偶然激活乾坤之宝圣魂骰子系统，获得了奇异古怪的神骰技能，解救了小师叔，打败了女修仙者霓纱，但是没有想到女修仙者霓纱对他有了爱慕之心。并且要把吴燃抓回宗门。女修仙者霓纱联合白龙王，一同进攻地球城池，想要获得乾坤之宝。最终，吴燃打败了霓纱，守护地球城池。
万年之前，仙王牧云因持有诛仙图而遭人暗算，残魂沉睡万年之后，在天运大陆南云帝国有名的“废物牧云”身上觉醒。牧云初醒，就受到了学生妙仙语的刻意刁难，牧云轻松的就化解了妙仙语的陷阱，并举一反三的说出了更多的炼丹技巧，让门外的炼丹大师莫问赏识不已。回到家中，牧云得知了要与秦家小姐秦梦瑶结亲的消息。秦梦瑶寒毒在身，活不过二十岁，结亲不过是为了牧家和秦家的利益。但牧林辰的劝说下，牧云以炼丹为条件，答应了这门亲事。炼出了淬骨丹，牧云的修为有了第一次提升。莫问时常来找牧云请教，而秦时雨一直想请莫问来治疗孙女秦梦瑶。莫问暗示让牧云一试，牧云阴差阳错下唤醒了体内的诛仙图，得知秦梦瑶体内的并非寒毒，而是冰凰神魄。牧云治好了秦梦瑶，冰凰神魄的力量使得秦梦瑶修为突飞猛进。在见识到了牧云的能力后，秦梦瑶对牧云充满了好奇和兴趣，于是成为了北云学院的导师，和牧云教导同一个班级。
龙武二十七年，天空突降怪雪，此雪不寒且温，亦不融，后世称之为“暖雪”。在 “暖雪“降下后的三个月，除魔组织“慈母教”的头号刺客狴犴奉命前往皇城，在这段路途中，关于这王朝由盛转衰、四大家族逆天而行的历史碎片徐徐展开……
算命为生的梁夕因一时善心救下仙人宇文青阳，被仙人传授万年真力和翻天印，从此踏上了修真之路。在宇文青阳的指示下，梁夕前往天灵门拜师学艺。而路途中，梁夕遇到了莫名亲切而一起同行的小白狐。 以天灵门作为修行起点的梁夕结识了朋友与师尊，又阴差阳错从妖兽身上获得了神秘兵器坎水刃。坎水刃乃是云麓仙居开山祖师的法宝武器，他们要求梁夕归还，但如果梁夕能让龙息淬炼坎水刃的话他们就不予追究，否则就要天灵门付出代价。看出云麓仙居是借故找茬的梁夕决心前往东海寻找龙族，却因为意外吸入龙族血液，成为了天地间第一位龙族外戚。在向龙神说明情况之后，梁夕达成了龙神提出的要求，成功让坎水刃被龙息淬炼，也救回了师门。 云麓仙居的出现不过是插曲，正值天灵门掌教青木道人突破金仙出关时，天灵门上空突然出现了空间裂缝，从中出现的双头老祖带着人面蜘蛛大举进攻，一度将梁夕掳到了人界之外，生命危机之时...
