古岁月，诸圣争霸。一个号称“睡神”的少年，因祸得福开启一门逆天功法。从此以后，一个肉体无双的奇才，横压天地，剑斩星辰，万千奇才在他脚下匍匐颤栗。群雄崛起的天地，唯我霸武独尊。
宇宙流浪汉李约素无意中发现了多年前失踪的移民飞船“上佳”号，并目睹了令人惊惧的异常现象……人们逐渐发觉了正在逼近人类的巨大危险，几经周折最终科尼尔星域各方势力不得不合力应对强敌。孰料，异族的强大超乎想象，科尼尔星域人类在全军覆没之际，只得派出李约素向银河之心的强大人类文明求救……
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
中国古典神话传说中的“著名”精怪是如何在现代社会生存下去，他们成为了我们身边有着神仙特色的宅女、暖男、上班族、犬系男友，他们上演着生活中搞笑而怪诞的小故事，关乎快乐、关乎友情，在我们平凡、忙碌的日常构建了不可思议的二次元神仙幻境。
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