地表上有着形形色色的动物，它们的外型与生态究竟是怎们来的呢？其实，天上有个负责设计生物的部门叫做「设计部」，他们煞费苦心发挥创意，就为了完成客户（神）提出的种种匪夷所思的难题。「为什么独角兽实际上不存在？」「好吃的生物具备什么条件？」「海中最强的动物是谁？」大自然的种种奥妙，全部来自「天地创造设计部」！
迪尔（冈本信彦 配音）是一位小有名气的冒险者，拥有冷静的头脑和强健的体魄，以及无量的前途。一次偶然中，正在执行讨伐魔兽的任务的迪尔，在森林里邂逅了脏兮兮又可怜巴巴的女孩拉缇娜（高尾奏音 配音），虽然拉缇娜是魔族的后代，但是迪尔不忍心看到她孤身一人无家可归，于是决定收养她。就这样，拉缇娜成为了迪尔的养女。 拉缇娜的存在让深藏在迪尔体内的父性彻底的爆发了。而善良可爱的拉蒂娜也很快就交到了好朋友——拥有领袖气质的克洛伊（桑原由气 配音）、外表年幼内心成熟的希尔维亚（高野麻里佳 配音）、正直勇敢的鲁迪（田村睦心 配音）。
现国（近藤孝行 配音）是一名平凡的普通青年，某一日，他来到了青锖学园任教，哪知道等待着他的，却是一段他怎么也想象不到的奇遇。原来，在这所学校里就读的学生们，每一个人都是一种枪械的化身，其性格亦反应了对应枪械的特性，在这里，现国会遭遇怎样的故事呢？ 外表乖巧可爱但到关键时刻就会暴走的芬子（野水伊织 配音）、身材姣好容貌秀丽却说着一口关西话的一六（富樫美铃 配音）、喜欢这芬子的希格（作图元相知 配音）、娇小可爱沉默寡言的艾儿（味里 配音）、有着双重人格的阿玖（古谷静佳 配音），在这些女孩子，或者说是枪械的包围下，现国的日常就此展开。
加奈（丰崎爱生 配音）打小父母双亡，如今，就连一直以来相依为命的祖母都离她而去，面对这个陌生和凶险的社会，小小的加奈该何去何从？在误打误撞之中，无家可归的加奈住进一家名为“风新”的报纸销售点，在那里，她将以打工的方式来支付她的房租。 在报社中，加奈遇见了许多善良开朗的朋友们，年纪小本领大的小学生代理社长天野咲妃（水原薰 配音）让加奈很是崇拜。再加上活泼淘气的同行北冈梦（广桥凉 配音）和外表御姐内心却有些天然呆的南有纪（远藤绫 配音），以及竞争对手“华日新闻专卖所”的送报娘久地院美华（钉宫理惠 配音），加奈的生活一下子就变得精彩起来。
「思い出して、翅（はね）があったころのことを」 1万2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。 太陽と月と火星が出会うとき、新たな合体の調べが流れる──！ 湘南の海に浮かぶ小島、江の島。 美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島学園〉はある。 学園には、全国から優秀な子どもが集められ、 最新の機器を使った英才教育が施されていた。 特殊強化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、 感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、 謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる。 戦いのさなか、不可思議なヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──。 「想星合体！ GO、アクエリオン！」 繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン。 宿命を背負った少年少女は、 得体のしれない団体〈宇宙たまごの会〉や大人たちの思惑が交錯す...
