与母亲和妹妹三人一起生活的高二学生·时野谷瞬。在父亲因事故去世，妹妹受伤后，他放弃了曾经痴迷的游戏，现在在电子竞技咖啡馆“FOX ONE”工作。 边与身为青梅竹马的游戏朋友交往，边忙于打工和学习的瞬，突然发现“FOX ONE”负有巨额债务。为偿还债务，瞬和其他人一起为取得“扎克塞里昂锦标赛”的胜利，并获得奖金努力。 怀着内疚的心情，瞬再次进入线上游戏的世界，而在他面前出现的是曾与他一起玩游戏的“爆裂君”。 在未知的相遇和经历，以及激烈的战斗中...瞬边苦恼着边他与伙伴们一起前进。 通过游戏开始的他们的世界。这是讲述少年和家人，还有伙伴们的故事──。
历经百年的时光，将人类与外侧世界隔开的墙壁。在墙壁的另一侧，似乎有前所未见的世界延伸开来。火焰之水、冰之大地、砂之雪原……记载在书中的，尽是些激发少年探究心的文字。在时间流转，墙壁被巨人毁坏的现在，人类正一步步接近世界的真相。巨人的真实身份是什么？为何墙壁中会埋着巨人？巨人化的艾伦·耶格尔所持有的“坐标”之力是？以及，西斯托利亚·雷斯究竟知道这个世界的什么事情？在艾伦等104期兵的加入下，建立新体制的利威尔班。最强最恶的敌人，阻拦在开始行动的他们面前。
深夜，挥舞巨大钢筋袭击人类的亡灵“钢人七濑”。是单纯的都市传说，还是真正的亡灵？给予妖魔鬼怪们智慧的巫女——岩永琴子，与之正面抗衡。为了消灭由人类想象力创造的恐怖妖怪，为了对抗虚构，琴子设下了由虚构组成的重重机关。
一名有沟通障碍，却被众人称为救世主的内向少年，驾驶一架具备自主意识的大型机器人，跟随宇宙战舰离开地球，踏上消灭银河怪兽的旅程。不料却在最终决战时意外落败，当下大型机器人决定启动自爆机能，并利用逃生舱将少年送回地球。只不过当少年平安抵达地球后，映入眼中的竟是一片雪白、毫无生机的结冻地球……
