《熊熊乐园3》在原有寓教于乐、制作精良的基础上，加入了“毛毛父亲”等一系列新角色，亲子主题贯穿整体故事，进一步满足了粉丝全家其乐融融一起看的需求。
万年之前，仙王牧云因持有诛仙图而遭人暗算，残魂沉睡万年之后，在天运大陆南云帝国有名的“废物牧云”身上觉醒。牧云初醒，就受到了学生妙仙语的刻意刁难，牧云轻松的就化解了妙仙语的陷阱，并举一反三的说出了更多的炼丹技巧，让门外的炼丹大师莫问赏识不已。回到家中，牧云得知了要与秦家小姐秦梦瑶结亲的消息。秦梦瑶寒毒在身，活不过二十岁，结亲不过是为了牧家和秦家的利益。但牧林辰的劝说下，牧云以炼丹为条件，答应了这门亲事。炼出了淬骨丹，牧云的修为有了第一次提升。莫问时常来找牧云请教，而秦时雨一直想请莫问来治疗孙女秦梦瑶。莫问暗示让牧云一试，牧云阴差阳错下唤醒了体内的诛仙图，得知秦梦瑶体内的并非寒毒，而是冰凰神魄。牧云治好了秦梦瑶，冰凰神魄的力量使得秦梦瑶修为突飞猛进。在见识到了牧云的能力后，秦梦瑶对牧云充满了好奇和兴趣，于是成为了北云学院的导师，和牧云教导同一个班级。
整个宇宙分为域内宇宙和域外宇宙，两个宇宙彼此为敌，域外宇宙由天魔统治，域内宇宙分为神界，仙界，凡间。 在宇宙中，像天罚大陆这样的凡间位面，数不胜数，其统称为：九天星域。九天星域中，九大仙帝统领九重之中所有星域。九天之上，乃炼仙神域，仙人最终化神之路，必要通过炼仙神域，方能凝聚神格，成为神，到达神界。神界万族林立，各族之神极为强大。在遥远的过去，神界万族，被始源至尊、混沌至尊，还有鸿蒙至尊统领。三大至尊，三足鼎立，统管神界、九天仙界。 鸿蒙神界之主鸿蒙至尊，身份尊贵，属下众多，为神界最强之人，精通天下万术。彼
天生残缺，孤注一掷，沈翔为打通灵脉身赴险地寻药，意外救下受伤的神魔二女，觉醒神脉。 守父亲，护家族，成一代丹神！
神尊意外坠入凡界，法力尽失。只因他破解飞升奥秘千年，不料第一步竟是化仙为凡，重头再来！神尊本想效仿其他修士，自此投入苦兮兮的修炼，谁曾想一个从天而降的厨娘，意外开启他“吃着也能升级”的新道路。自小以灵力为餐，露水为饮的九重天高贵神尊何时见识过这接地气的人间美味？他爱吃，多吃，还要抢着吃！直到他搜罗尽天下美食，顺便脚下跪满了臣服者之时，神尊才后知后觉发现：我竟然把自己吃成了无敌？！
入冷宫，失爱女，废后位……复仇暴君，冷心废后，她是他的皇后，却又是他最想除去的人；她是他的屈辱，他又是她的夙怨。破茧重生，弃情绝爱，她载恨华丽归来。几番对决，她笑言：“只差一步，可惜，你爱上了我！”多番较量，他怒称：“修罗地狱，也要你相伴左右！”
遥远银河彼端，闪耀着一颗孕育魔法神力的星球——维尔哈伦。大陆上存在着四个迥然各异的国家。来自南国的少年界海机缘巧合下进入一间名为“时之歌”的神秘藏书阁打工，在工作过程中结识了来自不同国家的神秘客人，而这些错综复杂的关系有意无意地将他卷入一场深关大陆命运的漩涡……
