本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
为阻异界镇守者入侵，守两界生灵，吕阳等剑宗翘楚无惧艰险，勇往直前，共御外敌！
第一部： 20世纪末一个初冬夜晚，不计其数的奇异卡片突然从阴霾的天空落下，散布到世 界各地。没人知道它们从何而来，作用何在。一年后，一个世界闻名的冒险家、考古 学家向世界宣布，他掌握能将卡片变成巨兽的咒语，并能操纵它们战斗。随着幻兽的 出现，人类社会的平衡秩序被打破。政府为了改变混乱局面，组织了两年一届的世界 御兽师争霸赛。从中挑选有才能的人，以维护世界和平.故事主角之一——祺翔十分羡慕御兽师这种职业，机缘巧合得到一只幻兽momo,之后和小伙伴玄福，希茹，以及化敌为友的朋特，开始了他们圆梦御兽师的旅程，他 们经过一系列比赛的磨练，克服了种种困难，一步一步向梦想靠近，但在这时可怕的黑暗势力，正悄悄向他们伸出魔爪…… 第二部： 这是一个全世界疯狂痴迷于卡片对战的世界。在这个世界，治理和保护环境被视为最神圣的职权。成名于世200余年的卡片世家宇...
在人类生活的世界里，存在着另一个完全独立的平行世界纳尤古。纳尤古由拥有魔法的精灵师和精灵组成，他们将人类世界称之为“大方块”。10岁的小学生包小龙，大方块的一名小学生，然而他天生就有点不同，常常把老鼠、蟑螂等动物们看成可爱的小精灵。小龙的异常得不到家人的理解，更被同学和小伙伴们排斥。有一天，一颗粉红色的流星飞进了小龙的眼睛里，他开始听得到小精灵们的心声。精灵们不断涌现，惊呼小龙就是“那个人”黄金龙的精灵师。正当小龙迷惑不解时，他收到来自纳尤古齐格威精灵师学校尤达校长的信。
蓝幼薇发现自己不仅被查出得了乳腺癌，丈夫还一直出轨她的闺蜜，发现真相的自己，反而被赶出家门，难道只能等死了吗？正当自己发着烧晕到在路边，一个自带柔光的男人将她抱了起来，体育老师向律一直暗恋着蓝幼薇，可是这个男人远没有外表上的那么简单。蓝幼薇落魄前半生，向律偏执而上。“从今往后，我一直在你身边！”。
【bilibili出品】为了那一抹璀璨的蓝色，我们无怨无悔，为了生命得以延续，没有什么可以阻止我们！ @大宇宙时代动画官方
传说，在世界顶点的十二个使徒中，祐尔曼是公认最强的存在。但同时他也是最让人类猜不透的使徒，因为没人知道他想要什么，财富？名声？势力？这些在他眼里都不值一提。而如今，这样一个传说中的使徒竟然悄悄的出现在了人类帝国的军队中。人类中隐藏的邪恶势力蠢蠢欲动，使徒力量的出现让各方势力躁动不安。
