县立学文高中一年级2班，那里有位刚一入学就得到全校注目的男子，他的名字叫坂本（绿川光 配音）。他戴着黑边框眼镜，个人特征是左眼下的泪痣。他不但相貌英俊，着装整齐，而且眼神凌厉，一举一动都华丽潇洒，帅气爆表，因此总能成为众人的焦点，受到女生们的疯狂追捧，但是也因此引起不少同龄男生的嫉妒，包括同班同学阿酱（杉田智和 配音），以及高二级学长8823（游佐浩二 配音）。对面男生们花样百出的陷害和报复，坂本总能帅气满分地完美解决这些麻烦，让男生们甘拜下风。 本剧改编自日本漫画家佐野菜见原作的同名漫画。
为求仙药线索，一行人抵达统治岛屿的怪物"天仙"之居城。 欲从岛屿生还，死囚与处刑人已不得不携手合作。 与此同时，幕府以"山田浅卫门殊现"为首，下令增派人员登陆神仙乡。 其中竟可见与画眉丸素有渊源的石隐众之身影。 正当画眉丸等人欲尽快寻得仙药逃离孤岛之际，天仙们却拦住了他们的去路—— 围绕仙药的争夺，即将迎来"人类"与"天仙"的全面对决——！！
炼金术，一种建立在等价交换原则基础上的科学，将物质进行理解、分解、再构造，将一种物品变成另外一种。但是，这样先进的技术却不能进行人体炼成，这是炼金术绝对的禁忌。可是，拥有极高炼金术天赋的爱德华（朴璐美 配音）和阿尔冯斯（钉宫理恵 配音）兄弟，因为对母亲极大的思念不惜触犯禁忌。而最终的代价却是，爱德华失去了一条手臂和一条腿，弟弟阿尔冯斯只能将灵魂依附在一副巨大的装甲之内。终于明白一切的兄弟俩，为了恢复原状，寻求更多的炼金术知识，成为国家炼金术师踏上了寻找终极炼金物品——贤者之石的旅程。在不断的探索中，两兄弟终于发现了贤者之石背后的真相，对身处的这个军事化国家也有了更深入的了解。此时，面对国家、民族、家庭……炼金术的未来究竟在何处。
