汉朝末年，董卓挟天子以令诸侯，战神吕布为其征讨，四方群雄并起。而大势决断，竟尽出一家之手，水镜门下八奇，谋冠天下。就在此时，一个神秘的刺客跟随他的商家主人悄然走进这个时代，牵出群英纷争，乱世无常……
斗魂圣地一战之后，为了拯救枯萎的灵界灵树，六支浇灌灵树灵液化作灵树之种，由紫染苍麟带回灵界的灵树圣地栽种。 谁知两人在圣地却遭到月族长老镜影花的袭击，镜影花欲吸收灵树之种的力量完成自己的野心，在苍麟拼死牵制下，紫染带着灵树之种开始逃亡，在被追杀途中意外碰到了从地界过来灵界的斗魂卫张山峰一行人。 得知镜影花要吸收灵树之种然后反攻地界的野心，斗魂卫一行人决定要保护紫染回灵树圣地种下种子。
第四季《万古仙穹4：银月城篇》接替上季内容，讲述了娲后三魂仅需找到最后一魂便可重生，古海为救小柔，前去银月城阻止大明王神寻到最后一魂。可银月城内却是更加艰险万分，古海将要面对新的挑战。
传说每当黑渊现世，就会有一场天道大劫毁灭诸天万界，重启宇宙。少年林飞因筋脉缺陷无法修行，靠着小聪明在问剑宗混吃等死，直到大劫来临，恩师与挚友战死在黑渊才为虚度光阴而追悔莫及。他历经险阻另辟蹊径，习得上古炼器法为师门报仇，与魔头渊皇同归于尽。岂料因为神秘力量的干涉，他又在重启的新纪元中重生。为守护从大劫中被神秘人传承下来的问剑宗，为了相同的惨剧不再上演，林飞决心从一名边缘弟子做起，修万剑之道，集群英之力，破天道大劫，续文明火种。
算命为生的梁夕因一时善心救下仙人宇文青阳，被仙人传授万年真力和翻天印，从此踏上了修真之路。在宇文青阳的指示下，梁夕前往天灵门拜师学艺。而路途中，梁夕遇到了莫名亲切而一起同行的小白狐。 以天灵门作为修行起点的梁夕结识了朋友与师尊，又阴差阳错从妖兽身上获得了神秘兵器坎水刃。坎水刃乃是云麓仙居开山祖师的法宝武器，他们要求梁夕归还，但如果梁夕能让龙息淬炼坎水刃的话他们就不予追究，否则就要天灵门付出代价。看出云麓仙居是借故找茬的梁夕决心前往东海寻找龙族，却因为意外吸入龙族血液，成为了天地间第一位龙族外戚。在向龙神说明情况之后，梁夕达成了龙神提出的要求，成功让坎水刃被龙息淬炼，也救回了师门。 云麓仙居的出现不过是插曲，正值天灵门掌教青木道人突破金仙出关时，天灵门上空突然出现了空间裂缝，从中出现的双头老祖带着人面蜘蛛大举进攻，一度将梁夕掳到了人界之外，生命危机之时...
