陆国国君身中剧毒，性命危在旦夕，消失5年的儿子陆尘强势归来，一改以往废柴的人设，摇身一变成为实力强横又多金的存在，只见他不费吹灰之力，拯救陆国于水火之中，动动手指便解除老爹身上的奇毒，究竟是什么让陆尘改头换面？听说是有好几个美女师父
《灵境幻世》是拥有超高人气的虚拟现实游戏，其开发者卢危达来自未来。卢危达在未来世界因为诈骗罪而被通缉，他潜逃到现世，用他掌握的未来科技，先于历史开发出灵境空间技术，从而赚取巨额财富。卢危达的真正目的是让游戏中的怪物基美拉出现在现实世界中，最终统治世界。为了抓捕卢危达，来自未来世界的超时空护卫队派出了灵境巡逻员陆彩风。陆彩风发现大学生龙小峰是合适的人选。龙小峰经过刻苦特训，成长为了一名优秀的战士。与此同时，基美拉开始出现在现实世界，龙小峰的妹妹龙玲玲也受到了卢危达的控制。为了找回妹妹、保卫家园，龙小峰开始了讨伐游戏中穿越而来的各种怪物的艰巨挑战。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
本剧讲述超级飞侠与超级宠物们乘着迷你基地前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在冰岛海域，他们通过声波探测设备，帮助海豚宝宝找到了海豚妈妈；在喜马拉雅山脉附近，他们把快要滚下山坡的小男孩基玛和爸爸以及巨雪人宝宝安全救下。尽管困难不断，但超级飞侠和超级宠物们每次都会带着炫酷的装备，圆满地解决问题。
