在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
赵赫洲的母亲为救嚣张跋扈的长女赵馨儿，不惜在身怀六甲之际，动用“太初混沌体”天赋，救回重伤的女儿。然而这一举动，却令未出世的赵赫洲根基尽毁，一出生便被定为废人，母子二人因此被逐出至尊赵家。殊不知，赵赫洲实为修罗魔神转世，九天十地皆曾臣服于他的威压之下。此世虽天生废脉，却携前世积累的“九亿属性点”重生。他将属性全数加满，踏血归来——为母正名，为自己复仇！
白小纯合并下游四宗成立逆河宗后，成功挑战中游三宗立稳脚跟，被上游星空道极宗天人指名做质子，开启第三季质子篇。
相传，在大漠中有座彩砂镇，这里的建筑都涂抹着一种美丽而神秘的彩砂，这些彩砂五彩斑斓星光闪耀，同时还有一种强大的魔力，可以保护小镇在狂沙四起的大漠中屹立不倒。一天，雪王慕名而来，却发现这里风沙肆虐，空无一人……
原创科幻废土动画，看一群年轻镖师们，如何克服重重困难，医治浩劫过后洪荒大陆的创伤。
