神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
身患绝症的年轻人李长寿，意外重生在封神大战之前的上古时代，成了一个炼气士。为了修得长生不老且能在残酷的洪荒安身立命，他低调行事，凡事谋而后动，从不轻易步入危险之中，藏底牌，修遁术，炼丹毒，直到有一天，他的师傅突然给他收了个师妹回来，本想低调修行的李长寿被卷入了一场场冒险。不动稳如老狗，一动石破天惊，动后悄声走人，在打败邪恶敌人的同时，结交志同道合的朋友，实现自己的人生价值。
