在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
遥远银河彼端，闪耀着一颗孕育魔法神力的星球——维尔哈伦。大陆上存在着四个迥然各异的国家。来自南国的少年界海机缘巧合下进入一间名为“时之歌”的神秘藏书阁打工，在工作过程中结识了来自不同国家的神秘客人，而这些错综复杂的关系有意无意地将他卷入一场深关大陆命运的漩涡……
上古末世，辉华族少女曦和自惨痛的族地叛乱中出逃，脱离穹冥魔族掌控踏上寻找屠魔神剑之路，掀起六军之战。
半月关之事告一段落,谢怜受神武大帝君吾的传唤回天庭述 职,却意外得知有神官在鬼市附近施法求救而鬼市如今的 主人“血雨探花“花城,正是七日前突然辞别的红衣少年三 郎,此事疑点重重,谢怜白愿请命,与风师青玄、东方武神郎 千秋一同秘访鬼市探查真相……
回到神秘侏罗纪，星猫教小朋友恐龙知识和勇敢精神。 黑魔王的元神从封印下逃脱，为了吸取足够的生命能源，黑魔王带领黑魔族小怪，来到地球上恐龙繁荣的侏罗纪，企图通过吸取恐龙身上的生命能源，强大自己的能量，让真身解封，统治宇宙。星猫与12星球战士及时降临，奋力阻止。当12星球战士对恐龙不了解时，星猫就会变成一个老师，手里拿着星杖，幽默的讲解恐龙知识，达到寓才于乐的目的。
这个世界是存在异人的。刚刚接触异人世界的张楚岚，加入了管理异人的组织“哪都通”。为了解开爷爷和自身的秘密，张楚岚和冯宝宝一起前往龙虎山天师府参加异人界的盛会——罗天大醮，并与众多异人高手对战。
网文作家赖晓光无意间进入了一个名为“上帝之手”的虚拟世界中。在这个奇幻的世界里，她变成了狼人大牛，并被卷入到了一起国宝失窃案中。为了调查真相，她不得不和羊王旺财一起踏上了旅程。
